После одного из недавних обновлений gnuplot стал в качестве терминала (устройства вывода) по умолчанию использовать wxt вместо обычного x11. wxt, конечно, в чём-то лучше: можно сохранить изображение в буфере обмена, можно настроить уровень сглаживания... Однако работает как-то медленнее, и, вдобавок, при выходе из gnuplot пишется:
(:25249): GLib-GObject-WARNING **: /tmp/buildd/glib2.0-2.14.1/gobject/gsignal.c:1741: instance `0x822cdd8' has no handler with id `123'
(:25249): GLib-GObject-WARNING **: /tmp/buildd/glib2.0-2.14.1/gobject/gsignal.c:1741: instance `0x83b5f20' has no handler with id `248'
(:25249): GLib-GObject-WARNING **: /tmp/buildd/glib2.0-2.14.1/gobject/gsignal.c:1741: instance `0x822c958' has no handler with id `50'
В общем, вернуть старый добрый x11 в качестве терминала по умолчанию просто. Для этого достаточно поместить команду выбора терминала в ~/.gnuplot:
$ echo set terminal x11 > ~/.gnuplot